相傳由弘法大師所刻、平等寺的本尊 藥師如來

據寺中相傳的由來記，弘仁五年（814年）的春天，弘法大師巡行此地，尋找建立伽藍的場所。大師登上北面的山，祈道：「若此處是密教得以弘揚、因緣深厚之地，願現出相應的徵兆。」便擲出一朵金色蓮華，那蓮華掛上一株古松的枝頭，向八方放光。

大師為這奇瑞所動，深入三昧，只見空中的光裡浮現出琉璃色的梵字，漸漸化為藥師如來的形貌。藥師如來告道：「我將眾生的苦，毫無分別地、平等地醫治去除。」並放出五色之光，照耀大師。

大師以每一刀便禮拜三次的「一刀三禮」作法，雕出這尊尊貴的法相。如此而成的，便是本尊藥師如來，以及輔佐祂的日光菩薩、月光菩薩，還有守護的十二神將。大師說：「松上的蓮華向八方放光，正是平等普及一切人的大誓願之徵。」便將此寺取名為平等寺。

也就是說，本尊是藥師如來，與寺名是「平等寺」，這兩件事是在同一段故事裡同時定下的。平等寺這個名字，正是藥師如來「毫無分別、平等醫治」這一誓願本身。

此外，大師為求加持之水，以獨鈷刺向山中的岩石，竟湧出如乳般潔白的泉水。這便是山號「白水山」的由來，此水至今仍被珍視為加持水。

現今的本尊，一般認為是仿照相傳為弘法大師親作的初代，於室町時代重新整備的第二代佛像。其形貌是以木材拼合而成的寄木造，再施以漆箔。尤其左手的藥壺為金屬所製，相傳已逾千年之久，至今仍承載著初代那段祈禱的記憶。

訴說這尊藥師佛靈驗的其中一例，便是奉納於本堂的「箱車」。大正十年（1921年），因脊髓的疾病而失去行走之力的筒井林之助，與他的父親福次，做了一輛能讓林之助躺臥其中的箱車，踏上四國遍路之旅。大正十二年（1923年），他們在第二十二番札所的平等寺停留四週，飲用白水山的靈水，並接受住持的加持祈禱，知覺漸漸恢復，最終竟能拄著金剛杖站起身來。父子二人懷著深深的感謝，將這輛支撐了性命的箱車，奉納給本尊藥師如來。

平等寺之所以作為足腰健全之寺廣受信仰，正與這樣的藥師如來靈驗相伴而來。祛病療疾、防癌、足腰健全。種種心願至今仍向著這尊本尊而來，堂中遍路巡拜之人從未斷絕。

日光菩薩與月光菩薩，代表藥師如來的光晝夜不停地照耀眾生。智慧之光並不是一瞬的靈光乍現，而是包覆生活整段時間的光。

十二神將是發誓護持藥師如來的教法、守護受持經典之人的諸位。面對病與災厄的信仰之所以伴隨著具體的守護形象，正是源於此。

在平等寺禮拜藥師如來時，若不只看本尊，連同周圍展開的這片光與守護的世界一起領受，信仰的厚度便會顯現出來。

經典中說，光是聽聞藥師如來的名號，本身就有重大的意義。所謂聽聞名號，並不只是耳朵聽到聲音，而是知曉這份願力究竟朝向何處。

在平等寺向藥師如來祈禱時，也請先確認：此刻自己正為什麼而苦，又想重新振作起什麼。無論是身體的不適、心中的不安、家人的事，還是生活的艱難，從哪裡開始祈禱都無妨。

在此之上，真言會成為調整心境的一條短短的途徑。即使不必把意思全部弄懂也無妨，但要緊的是別忘了自己究竟為何而唱。